冷链物流体系严重落后于行业需求;最后两公里配送解决方案欠缺，生鲜行业混乱，缺少基本的标准化、品牌化、规模化。京东、天猫、美肉网、顺丰纷纷自建物流。
物流体系是电商发展的先决基础，但对于初期阶段的生鲜电商企业来说，现有的这个基础过于薄弱。以冷链物流需要的冷库为例，2015年中国冷库约为8000万立方米，人均还不到0.1立方米，远低于国际平均水平0.3立方米。而且多仅限于肉类、鱼类的冷冻和贮藏，功能相对单一。加上行业集中度低，排名前十的冷链仓储运营商只占整个市场的10.5%，甚至可以说没有全国性或大区域性的冷链物流网络，根本无法满足生鲜电商的基本需要。
虽然从长远看，行业标准化、品牌化、规模化问题生鲜电商最大的瓶颈，但冷链物流运输和落地配送才是急所。因此在解决物流和供应链更有效率的自营模式成为主流，而且生鲜电商主动或被动投入到冷链物流体系的建设之中。京东宣布投入100亿建设第三张物流大网，本来生活、易果生鲜、每日优鲜等其他垂直生鲜电商也纷纷开展自建，包括倒闭的美味七七和壹桌网也不例外。过重的资产模式占用了企业过多的资金和精力，倒闭的生鲜企业在某种程度上也可以说是被物流折磨死的。
未来，随着市场需求的增多，冷链物流第三方服务商也会慢慢发展，但由于投资成本巨大且专业性和管理要求比较高，这个周期会比较长，且会滞后较多。